ヽ(´ー`)ノ


2005-11-01 [長年日記]

[P] 中間報告会

(03:01) 真夜中の ci

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2005-11-02 [長年日記]

[P] クーデター?

(09:20) iPod がフリーズ.再生ボタンを押すと固まるパタン.

(10:30) 眼科にいかないと

(14:46) 身辺整理をすすめる

(15:46) メールを送った

(16:30) -cvs が流れている

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2005-11-03 [長年日記]

[P] 文化の日

(15:30) パンとチーズ

(17:10) 目次の間を埋める

(18:10) ホットカーペットを投入

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2005-11-04 [長年日記]

[P] TCS 2/3

(00:54) なにやら第五の挙動がおかしい

(13:20) 振り込み

(15:30) MC1やタルタルーガの新型やFrogなどなど

(17:49) 思わぬところから返信

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2005-11-05 [長年日記]

[P] ピザ

(01:08) 術語の熟成していない分野で文章を書くのは大変なことだなあ(JJBBKT)

[D] section とかに label を

いままで手で書いていた「第 3 章を参照」のような相互参照の自動作成のために chapter,section,subsection,subsubsection に label つけたり.

そうすると,?label{c:m} を参照するには,

第 ?ref{c:m} 章を参照

と書けば良い.

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2005-11-06 [長年日記]

[P] 雨

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2005-11-07 [長年日記]

[P]

(00:28) 機械的にできる範囲で RDoc を施す子プロセスをフォーク

(01:27) どうも,データ更新されるタイミングと更新を表示するときにデータを読み込むタイミングが合っていないようで

[Bio] Open Bio BoF @ GIW2005

登録しました. 今年もやります. 希望通り採択されれば A + B です.

(追記)採択されました. A + B で 14:00-18:00 確保.

[Res] cvs レポジトリに 595M ほどの .gz なファイルをおくのはおすすめできない

レポジトリ側の cvs プロセスが 595M 以上のメモリを消費したり,いつまでも checkout が終わらないような気分になる.

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2005-11-08 [長年日記]

[P]

(18:10) t 氏がきてた

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2005-11-09 [長年日記]

[P] 寒いらしい

(09:30) ゆりかもめのホームの表示が「調整中」

(13:30) A社から電話

[Ruby] puts ((365 * 3) + 356) * 24 * 60 * 60 がエラーになったりならなかったり

puts((365  * 3) + 356) * 24 * 60 * 60

と解釈され

undefined method `*' for nil:NilClass (NoMethodError)

Mac OS X 10.3 で Ruby 入門をしているひとからなんでエラーになるのか聞かれて 5 分ほどわからなかった. Mac OS X 10.3 には ruby 1.6 系が入っている.

ruby 1.8 以降だと

puts(((365  * 3) + 356) * 24 * 60 * 60)

と解釈され

126230400
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2005-11-10 [長年日記]

[P] ユーザ会

(11:30) Out of Service

(20:30) 出勤

[Mac] .Mac 購入

マシン依存性を減らしていきたい.

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2005-11-11 [長年日記]

[P]

(15:40) 諸手をあげて

[Mac] Powerbook のクリックボタンがおかしくなりつつ

クリックのつもりがクリックされたままになることがしばしば. ウェブブラウザでリンクをクリックしても何もおこらず,ポインタを動かすとリンクオブジェクトがついてくる感じ.

[Res] citation += 1 

定点観測の結果, Search for citing articles in: ISI Web of Science (1) を発見. ISI Web of Knowledge を経由して, 引用している論文へ.

Comparative genomic analysis reveals a novel mitochondrial isoform of human rTS protein and unusual phylogenetic distribution of the rTS gene
Ping Liang , Jayakumar R Nair , Lei Song , John J McGuire and Bruce J Dolnick BMC Genomics 2005, 6:125 doi:10.1186/1471-2164-6-125

引用箇所,

A recent study suggests that many alternative splicing forms cause differential subcellular localization, especially in targeting either peroxisomes or mitochondria [17], and our data serves as evidence supporting such a notion.

[BioMed Central | Full text | Comparative genomic analysis reveals a novel mitochondrial isoform of human rTS protein and unusual phylogenetic distribution of the rTSgeneより引用]

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2005-11-12 [長年日記]

[P] 雨

(02:32) 着地点が見えてきた,かも

(13:33) 分岐してみる.ここはだらだらと,Cは淡々と,nはシャキーンとしたい(希望).要約すると文体のこと.

[Hoge] ヨーロッパ秋まつり

さすが東京.

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2005-11-13 [長年日記]

[P] 曇り

(15:32) 寒い

(16:05) PowerBookのパームレストの温もりがここちよいこのごろ

[D] 全体が 1X 以上に

これから finishing

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2005-11-14 [長年日記]

[P]

(02:21) 読み返すたびに発見がある.

(17:06) 計画停電の季節です

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2005-11-15 [長年日記]

[P]BioPAX ハッカーソン,M7.1

(00:05) M が落ちとった。都市名サーバ.

[Mac] WebKit ではクッキーはシングルトンだった

Safari でログインして,Shiira でログアウトできた. いやな仕様だな.

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2005-11-16 [長年日記]

[P] BioPAX f2f

(02:13) 昨日は対称性があったような気がした.

(16:44) 俄に移行しつつ

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2005-11-17 [長年日記]

[P] BioPAX f2f

(02:04) 「ぼじょれーあけますか?」っていわれても

(12:30) 精度設計/達成率

(16:29) k 氏のトークは盛り上がっていた.さすが

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2005-11-18 [長年日記]

[P] シンポジウム

(04:04) なんでこんな時間に

(10:00) 年末調整書類に追われる

(18:00) 計画停電対策.32台連続終了

[Res][Mac] 某ウェブアプリが Safari ではエラーになって FireFox では正常に振る舞う件について

2002/05/20 07:36:15 ごろにいじっていた某ウェブアプリは(いまだったら Ruby on Rails で書き換えるような代物ですが),一ファイルで cgi で動く軽いもの. 最近どこかでつかわれたという話を伺い,久しぶりに cvs co してインストールして見るとエラーがでた. 不要な require がのこったままになっていた.

とりあえず直してインストールして,いつものように Safari でデモデータをながして,実行していると,

HTTP/1.1 200 OK
Date: Thu, 17 Nov 2005 18:15:46 GMT
Server: Apache/1.3.33 (Darwin)
なにかのオブジェクト.inspect

Content-Length: 42778
Keep-Alive: timeout=15, max=99
Connection: Keep-Alive
Content-Type: text/html

<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01//EN" "http://www.w3.org/TR/html4/strict.dtd">

とHTTPヘッダーが壊れて, Content-Type: text/plain 扱いで表示されてしまいました. ところが,FireFox ではこれでも Content-Type: test/html 扱いにみえる. もしかしたら,HTTPヘッダーがなくても html っぽいファイルがきたらhtmlで表示しているのだけなのかもしれないけど.

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2005-11-19 [長年日記]

[P] 計画停電(b-Src)〜17:30

(13:16) 晴天

(15:42) 色づき始めた銀杏並木の 木枯らしに 揺れる木漏れ陽 もう落日

[Res] 502 Proxy Error

計画停電の復旧に手間取る.

  1. /etc/resolv.conf の nameserver がおかしな値だった.全日まで動いていたのが不思議なほど
  2. gonzui-server のレスポンスが遅い.調査中.
  3. w3m http://localhost:46984 でもつながるのに数分かかるような.

帰宅後自宅からアクセスすると通常のレスポンスを確認. 何に依存していたのだか不明.

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2005-11-20 [長年日記]

[P] 快晴

(12:05) 〈ちょっとした修正(RSSを更新しない)〉チェックボックスがあるぞ

(21:30) 2/31しか起動しないとメールが.

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2005-11-21 [長年日記]

[P] IP

(11:00) 完了

(12:00) 再起動したように見えるが,ログインウインドウまでいかない.

(20:18) やたらとウイルスメールが多い日

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2005-11-22 [長年日記]

[P] B,良い夫婦の日

(17:41) 指がどんどん細くなっていく

[D] 3X と図の追加

3X でほぼ構成は完成. 説明のために共起関連の図を新しく作成した. 毎ページ図か表があるのでほとんど絵本状態. 図を書くにはナンバープレイス(様なもの)を解く必要がある.

そして数ページ A4 両面印刷してみて, Preview.app で見ている見開きは表裏を開いて表示していることに気がつく.

[Res] プリフェッチとデータ公開

"WebCopier v4.2" という UserAgent で b-Src をプリフェッチしているひとがいる. いまちょうど HMMER まで進んだようである。 どうもドイツの巨大電気メーカーのなかからのようで, German.pm にも参加しているらしい.

さてここでオプションを考える.

  1. プリフェッチを拒否する
  2. gonzui のインデクスをダウンロード可能にする
  3. インストールされているパッケージとインデクシングスクリプトを公開する
  4. インデクスを公開したうえでプリフェッチを拒否する

gonzui のインデクスは 2GB くらいある点と,ほかのアーキテクチャで使えるのか不明なものを公開する意味があるのかという点で公開について疑問がある. インデクススクリプトは,実は無い.手動. インストールされているパッケージは近いうちに別のサーバから公開する予定はある. サーバの負荷自体は実際問題になるほどではないのでアクセスを拒否する必要はまだない.

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2005-11-23 [長年日記]

[P] いい天気,勤労感謝の日

(14:00) 近くの喫茶店で校正 4X を進める.

[Bio] Peroxisome

  • 1,190,000 peroxisome
  • 10,300 ペルオキシソーム
  • 394 ペルオキシゾーム
  • 23 ペロキシソーム
  • 21 ペロキシゾーム
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2005-11-24 [長年日記]

[P] M に

(00:19) がーん.見直したのに.

(01:33) M に参入したらしい.

(14:04) うまく行ったかも.

[D] 5X で cite{} を埋める

引用のなさげな怪しい文章を葬り去る.

CiteULike は author = "International Human Genome Sequencing Consortium" ができない仕組みでやや困る. Gene Ontology でも問題か. あと,できれば  BibTex Export をダウンロードだけではなくて,text/plain でブラウザで表示できればと. 一時的にファイル作りたくないので.

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2005-11-25 [長年日記]

[P] 認可

(16:28) すすまん ssmn

(18:48) ほとんど負荷テスト状態.そしてたまに落ちる.

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2005-11-26 [長年日記]

[P] はやぶさ

(08:30) どうしたものかのう.

(15:53) 機種変したい

(18:48) 〈だ/である〉から〈です/ます〉へ. from da/dearu to desu/masu. kkii !

(23:49) -m 8 と -m 9 間違えてた

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2005-11-27 [長年日記]

[P] 辺縁部からクロロフィルが欠落しつつ

(00:37) 音場感は良いのだが,ユニットの限界がみえてきてしまつた

(11:35) 2.0 って post- のように使われているのね.でも post- のような打ち止め感が無い。相対的でないから. NG も同様に相対的だな.

(21:21) とりあえず,完了

[Mac] Grab.app でキャプチャーしたあとに Cmd-C して,Preview.app で〈ファイル〉メニュー→〈クリップボードから新規作成〉すると余計な TIFF 画像を残さなくていい

キーボードショートカット的には

  1. Cmd-c コピー
  2. Cmd+tab アプリケーションの切り替え
  3. Cmd+n クリップボードから新規作成

さらに Grab.app の起動は QuickSilver.app で g→return だけ. QuickSilver.app の呼び出しは  enter . Powerbook G4 だとカーソルのとなりが  enter なので便利.

Grab.app は TIFF  でしか保存できないのが不満. Preview.app はトリミング時にサイズが分からないことと画像のリサイズができないのがたいへん不満.

[OS] google://改ページする tag

ずっと知りたかったけどちゃんと調べていなかった html 書類を印刷するときに改ページを挿入する方法が分かった検索. H2 タグの前で改ページしたいとき

H2 { page-break-before: always; }

HR の後で改ページしたいとき

HR { page-break-after: always; }
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2005-11-28 [長年日記]

[P] イン

(09:00) 入電

(10:00) 来年の予約をする

(11:00) 2+2+2

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2005-11-29 [長年日記]

[P] k1/3

(00:03) 印刷用の CSS では font-size を絶対値にするといいのか.

(11:22) Carbon Emacs のスクロール,再描画の速度に苛立をかくせない.

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2005-11-30 [長年日記]

[P] 閉切りたい

(01:30) ちなみに〈「ちなみに話」〉ばかりです.

(04:29) ツンドラってあれだ

(13:22) 機種変更 39,800- で確定

[D] RC1

83 ページに16 個の図と16個の表からなる 2.5MB .

本日のツッコミ(全6件) [ツッコミを入れる]

Before...

Ω なかお [予約開始日が微妙]

Ω so [とても素敵だが、あれを顔に当てて会話は微妙に恥ずかしい?[Y/n]]

Ω なかお [そこでハンズフリーですよ]

Ω so [あー、あれにSkype用のUSB接続の受話器をつなぐと..。]

Ω なかお [そうそう,黒電話の.ってハンズフリー?]

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