ヽ(´ー`)ノ
2004-07-21
♭ [BioRuby] cvs ci lib/bio/db/embl.rb lib/bio/db/embl/sptr.rb lib/bio/appl/psort.rb
lib/bio/db/embl.rb
bioruby-ja で報告のあった RG 行対応。 <URL:http://kr.expasy.org/sprot/relnotes/sp_news.html> 参照。
lib/bio/db/embl/sptr.rb
同じく、RG 行対応。 GN 行とか、CC 行とかたぶん、うまくいっていないとこ満載の予感。 GGBB。
テストスクリプトを若干変更。 RuntimeError がおこってとまらないようにした。
ruby stpr.rb uniprot_sprot.dat |egrep '^RuntimeError'
で、例外の発生するエントリが拾えるようになる。 現リリースの uniprot_sprot.dat では real 337m user 226m sys 24m @Pen4 3.00GHz でした。
lib/bio/appl/psort.rb
CGI の引数をつくる arg_join に key=value の組を結合する文字を引数で指定できるようにした。 いままではメソッドのなかで決めうちしていたものを、デフォルト値で設定して、そとから変更できるようにした。 現行の psort.cgi は '&' で決めうちなので、 ';' をつかうとうまく動かない。 きっとCGI.pmとかつかわないでがんばっているのでしょう。
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2005-07-21
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Ω T井(アニオタ) [食べに行ってみる?]
Ω なかお [いいねぇ]
Ω ichi [いいなぁ、野田岩?]
Ω なかお [論文でたらいきましょう、野田岩。]